Cette formation est organisée en partenariat avec l'Inserm et bénéficie du support de la plateforme ABiMS de Roscoff pour l'infrastructure Galaxy.

La formation s'adresse à des chercheurs, ingénieurs, médecins, doctorants et post-doctorants ayant des projets faisant appel aux puces à ADN.

OBJECTIFS :

Approfondir de manière théorique les concepts et méthodes liés à l'analyse du transcriptome par puces à ADN
 Savoir analyser des données de transcriptome (puces à ADN) sous l'environnement Galaxy
 S'initier à l'interprétation biologique des résultats obtenus


Programme
  • Introduction aux puces à ADN. Plans expérimentaux
  • Introduction à Galaxy
  • Contrôle qualité des signaux
  • Normalisation et filtrage des données
  • Méthodes de classification
  • Recherche de gènes différentiels
  • Annotation fonctionnelle des clusters
  • Application à son propre jeu de données

SESSION 2014 : à Nantes, du 9 au 11 Décembre

MÉTHODES :
Les parties théoriques permettront d'introduire les notions mises en pratique sous forme de TP, à partir de jeux de données publiques Affymetrix et Agilent.

Théorie : 30% / Pratique : 70%

Un poste de travail par stagiaire.

Les participants qui le désirent pourront, le dernier jour, analyser leur propre jeu de données.

Contacts

  • Inscriptions auprès de Michèle HAYS, responsable formation INSERM DR Grand Ouest, Tél : 02 40 35 86 80
  • Informations supplémentaires sur le contenu et le déroulement de la formation auprès de Raluca TEUSAN, responsable formation de la Plateforme BiRD, Tél : 02.28.08.00.54