BiRD met à disposition une infrastructure informatique de type cluster associé à du stockage. Cette ressource de calcul est environnée avec de nombreux d'outils dédiés à la bioinformatique, plus particulièrement aux analyses de données NGS.

Ce cluster de calcul est composé de :

  • 10 noeuds bi-processeurs Intel Xeon (560 coeurs au total)
  • 2 To de RAM (4Go/coeurs)
  • associés à ~400 To de stockage BeeGFS

Cet équipement est hébergé dans le datacenter de l'université de Nantes.

Accès

  • en ligne de commande, sur le serveur frontal du cluster de calcul (protocole SSH) :
ssh -X utilisateur@bird2login.univ-nantes.fr

La soumission des tâches doit se faire par l'intermédiaire du gestionnaire de travaux (SGE).

Un portail contient les informations nécessaires pour accéder au cluster et connaître les outils et ressources installés :

http://bird2cluster.univ-nantes.fr


Pour tous renseignements complémentaires, merci de contacter pf-bird@univ-nantes.fr